สาขาวิชาเภสัชกรรมคลินิกดำเนินการสอน วิจัย และบริการวิชาการที่เกี่ยวข้องกับการบําบัดรักษาด้วยยาและป้องกันการเกิดโรคที่มาจากการมีพฤติกรรมสุขภาพที่ไม่เหมาะสม โดยมุ่งหวังให้นักศึกษาสามารถประยุกต์ใช้ความรู้ทางเภสัชวิทยา เภสัชจลนศาสตร์ และหลักการใช้ยาบําบัดโรคในการดูแลผู้ป่วยในลักษณะสหสาขาวิชาชีพทางด้านสาธารณสุขโดยสามารถออกแบบแผนการใช้ยาให้เหมาะสมตามบริบทของผู้ป่วยแต่ละรายและสมเหตุผล เพื่อให้ผู้ป่วยได้รับประสิทธิภาพ/ประสิทธิผลจากการใช้ยาและมีความปลอดภัยสูงสุด อีกทั้งมีการค้นหา แก้ไข และป้องกันปัญหาที่เกี่ยวข้องกับการใช้ยา เภสัชศาสตรบัณฑิตที่สำเร็จการศึกษา สามารถปฏิบัติงานในฐานะเภสัชกรในโรงพยาบาล ร้านยาและสถานบริบาลทางสาธารณสุขที่เกี่ยวข้องอื่นๆ ได้อย่างมีประสิทธิภาพ ภาควิชายังมีการสอนและวิจัยทางด้านเภสัชวิทยาของยากลุ่มต่างๆ รวมทั้งการวิจัยเกี่ยวกับฤทธิ์ทางเภสัชวิทยาของสารสกัดจากสมุนไพรที่ใช้ทางยา เพื่อคัดกรองสมุนไพรที่มีแนวโน้มสามารถนำมาผลิตเป็นยาได้ต่อไป นอกจากนี้ภาควิชายังได้มีการสอนและวิจัยทางเภสัชระบาดวิทยาในแง่ความปลอดภัยของยาต่างๆ ซึ่งข้อมูลทางด้านเภสัชระบาดวิทยาจะมีประโยชน์อย่างยิ่งต่อหน่วยงานต่างๆ ในการวางแผนเชิงนโยบายเพื่อการคุ้มครองผู้บริโภคด้านยา ซึ่งจะเป็นประโยชน์ให้แก่ประชาชนผู้บริโภคยาต่อไป

        สาขาวิชาเภสัชเคมีมีการเรียนการสอนและวิจัยทั้งในระดับปริญญาตรี และบัณฑิต ศึกษา โดยแบ่งสาขาย่อยออกเป็น

1. สาขาย่อย Pharmaceutical Synthesis and Medicinal Chemistry จะมีการเรียนการสอนและวิจัยที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ยา สารช่วย หรือวัสดุที่เกี่ยวข้องกับงานเภสัชกรรม มุ่งที่จะทําการศึกษาเพื่อปรับปรุงหรือดัดแปลงโครงสร้างของยาเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพในการรักษาและลดความเป็นพิษหรืออาการไม่พึงประสงค์ของยา โดยอาจใช้วิธีสังเคราะห์ทางเคมีหรือ โดยเทคนิคทางเทคโนโลยีชีวภาพ ส่วนการสังเคราะห์สารช่วยหรือวัสดุที่เกี่ยวข้องกับงานเภสัชกรรมนั้น มุ่งที่จะค้นหาสารเพื่อทําการพัฒนาให้ตํารับมีประสิทธิภาพ ในการรักษามากขึ้น
2. สาขาย่อย Pharmaceutical Analysis จะมีการเรียนการสอนและวิจัยที่เกี่ยวข้องกับการวิเคราะห์และการควบคุมคุณภาพยา เป็นการศึกษาปรับปรุงและพัฒนาวิธีวิเคราะห์ทั้งในเชิงคุณภาพและปริมาณ โดยวิธีทางเคมีชีวภาพ หรือโดยเครื่องมือวิเคราะห์ที่มีประสิทธิภาพ ทั้งนี้เพื่อช่วยในการวิเคราะห์ตัวยาสําคัญ สารช่วย สารพิษหรือ สารที่เกิดจากการสลายตัวของตัวยาสําคัญในตํารับยา เพื่อประโยชน์ในการควบคุม คุณภาพยา และวิเคราะห์ยาในตัวอย่างจากสิ่งมีชีวิตและตัวอย่างจากกระบวนการทาง เทคโนโลยีชีวภาพ เช่น เลือด ปัสสาวะ หรือน้ำลาย เพื่อเป็นการ ติดตามคุณภาพของยา ในด้านการรักษา การศึกษาชีวสมมูลและเภสัชจลนศาสตร์ของยา รวมทั้งการวิเคราะห์หาชนิดและปริมาณของสารปนเปื้อนในผลิตภัณฑ์ เช่น ยา หรืออาหาร การศึกษาความคงตัวทางเคมีและทางกายภาพของสารเหล่านั้น
3. สาขาย่อย Pharmaceutical Biotechnology จะมีการเรียนการสอนและวิจัยที่เกี่ยวข้องกับเทคโนโลยีชีวภาพทางเภสัชกรรม ศึกษาโครงสร้าง หน้าที่ของสารพันธุกรรม เทคนิคทางพันธุวิศวกรรม การควบคุมการแสดงออกของยีนในสิ่งมีชีวิตชนิดต่างๆ การเพาะเลี้ยงเซลล์สัตว์ การพัฒนาและสังเคราะห์ยาทางเทคโนโลยีชีวภาพ การแยกและทําผลิตภัณฑ์ให้บริสุทธิ์ รวมทั้งการประยุกต์ใช้เทคโนโลยีชีวภาพทางเภสัชกรรม เช่น การศึกษากลไกการเกิดโรค การศึกษาเป้าหมายยา เป็นต้น รวมทั้งการวิเคราะห์ผลิตภัณฑ์ทางด้านเทคโนโลยีชีวภาพ และการศึกษาผลของยาต่อโครงสร้าง และการทํางานของสารชีวภาพ

        สาขาวิชา ฯ รับผิดชอบการสอนรายวิชาตามหลักสูตรเภสัชศาสตรบัณฑิตทั้งสาขาวิชาเภสัชกรรมอุตสาหการและ สาขาการบริบาลทางเภสัชกรรม หลักสูตรเภสัชศาสตรมหาบัณฑิต (เภสัชศาสตร์) และหลักสูตรปรัชญาดุษฎีบัณฑิต (เภสัชศาสตร์) ที่มีรหัสนำ 565, 566 หรือ 567 และยังร่วมสอนในรายวิชาอื่นๆ ในแต่ละหลักสูตรด้วย

        บุคลากรในภาควิชา ฯ มีคุณวุฒิในระดับสูง มีตำแหน่งทางวิชาการทั้งในระดับศาสตราจารย์ รองศาสตราจารย์ และผู้ช่วยศาสตราจารย์ ซึ่งนอกจากรับผิดชอบการสอนและเป็นอาจารย์ที่ปรึกษาวิทยานิพนธ์แล้วยังมีโครงการวิจัยและมีผลงานตีพิมพ์เผยแพร่อย่างต่อเนื่อง รวมทั้งยังได้รับการพิจารณาสนับสนุนทุนกาญจนาภิเษกสำหรับนักศึกษาระดับปริญญาเอกอีกจำนวนหนึ่ง

        สาขาวิชา ฯ ให้บริการวิชาการในการตรวจวิเคราะห์เภสัชภัณฑ์ หรือสารที่เกี่ยวข้องทางเภสัชกรรม การสังเคราะห์ยา ร่วมให้บริการศึกษาวิจัยด้านชีวสมมูล การศึกษาความคงตัวของยาและเภสัชภัณฑ์ และให้บริการตรวจวิเคราะห์ผลิตภัณฑ์เพื่อสุขภาพและความงามจากชุมชน

     สาขาวิชาเทคโนโลยีเภสัชกรรม ก่อตั้งขึ้นพร้อมกับคณะเภสัชศาสตร์ ในปี พ.ศ.2521 ชื่อเดิมคือ ภาควิชาเภสัชอุตสาหกรรม โดย สาขาวิชาเทคโนโลยีเภสัชกรรม รับผิดชอบงานการเรียนการสอนในหลักสูตรของคณะเภสัชศาสตร์ 5 หลักสูตร คือ

1. หลักสูตรเภสัชศาสตรบัณฑิต สาขาเภสัชกรรมอุตสาหการ (หลักสูตร 6 ปี)
2. หลักสูตรเภสัชศาสตรบัณฑิต สาขาบริบาลเภสัชกรรม (หลักสูตร 6 ปี)
3. หลักสูตรเภสัชศาสตรมหาบัณฑิต สาขาเภสัชศาสตร์
4. หลักสูตรวิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาวิชาวิทยาศาสตร์เครื่องสำอาง (หลักสูตรนานาชาติ)
5. หลักสูตรปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาวิชาเภสัชศาสตร์

     การเรียนการสอนและการทำวิจัยของสาขาวิชาจะเกี่ยวข้องกับการเตรียมผลิตภัณฑ์ยาในรูปแบบต่าง ๆ ทั้งยาที่ใช้ภายนอก และยาที่ใช้ภายใน ทั้งปริมาณน้อยจนถึงขั้นอุตสาหกรรม 

     ศึกษาเทคนิคในการเตรียมยา คุณสมบัติทางเคมีและกายภาพของตัวยาต่าง ๆ การพัฒนาสูตรตำรับยา เครื่องสำอาง และอาหารที่ให้ทางหลอดเลือดดำ เทคโนโลยีการผลิตยาชนิดต่าง ๆ เช่น ยาเม็ด ยาน้ำ การเคลือบยาเม็ด การเตรียมเภสัชภัณฑ์ปราศจากเชื้อ ผลิตภัณฑ์ยาสูดพ่น ระบบนำส่งยา เภสัชภัณฑ์รังสี เภสัชบรรจุภัณฑ์ ผลิตเภสัชภัณฑ์อาหารที่ให้ทางหลอดเลือดดำ

     การควบคุมและตรวจสอบคุณภาพของผลิตภัณฑ์ในกระบวนการผลิต การทำจุลชีววิเคราะห์ ตลอดจนการออกแบบการวางผังโรงงานตามหลักเกณฑ์วิธีการที่ดีในการผลิตยา (Good Manufacturing Practice)

     สาขาวิชารับบริการวิชาการให้แก่หน่วยงานและบุคคลทั่วไป ในส่วนที่เกี่ยวข้องกับการให้ความรู้ คำปรึกษา การวิจัย พัฒนาและการวิเคราะห์ด้านผลิตภัณฑ์ยาและเครื่องสำอาง บริการผลิตเครื่องสำอางและจำหน่ายเครื่องสำอางที่ผ่านการวิจัยและผลิตโดยสาขาวิชา

        สาขาวิชาเภสัชเวทและเภสัชพฤกษศาสตร์ ทําการสอน วิจัย และบริการวิชาการเกี่ยวกับสมุนไพร ตลอดจนผลิตภัณฑ์ธรรมชาติที่นํามาใช้เป็นยารักษาโรค ศึกษาวิธีวิเคราะห์ และจําแนกชนิดของพืชและสมุนไพรต่างๆ การจัดกลุ่มสารเคมีของพืชแต่ละชนิดที่จะนํามาใช้ประโยชน์ทางยา การกําหนดมาตรฐานสมุนไพร การศึกษาทางเคมีของสารสําคัญที่มีฤทธิ์ทางยา ตลอดจนวิธีการสกัดเพื่อแยกสารและพิสูจน์โครงสร้างทางเคมีของสารที่ได้จากพืชสมุนไพรและผลิตภัณฑ์ธรรมชาติเพื่อนํามาใช้เป็นยารักษาโรคตลอดจนการเพาะเลี้ยงเนื้อเยื่อสมุนไพรเพื่อประโยชนในการเพิ่มผลผลิต ปรับปรุงคุณภาพสมุนไพรและอนุรักษ์พันธุ์พืชสมุนไพร รวมถึงการศึกษากระบวนการชีวสังเคราะห์ในพืช

สาขาวิชาบริหารเภสัชกิจสอนวิชาที่เกี่ยวกับ

1. หลักการบริหาร สังคมศาสตร์และเศรษฐศาสตร์ที่ใช้ในการประกอบวิชาชีพเภสัชกรรมทั้งในโรงพยาบาล ร้านยา บริษัทยา และองค์กรต่าง ๆ ทางเภสัชกรรม
2. ระบบสาธารณสุขและระบบต่าง ๆ ที่เกี่ยวกับยาของประเทศซึ่งเภสัชกรมีบทบาทในการทำงาน เช่น การขึ้นทะเบียนยา
3. การคุ้มครองผู้บริโภคทางด้านยา อาหาร และผลิตภัณฑ์สุขภาพ ระบาดวิทยาและกฎหมายต่างๆ ที่เกี่ยวข้องกับวิชาชีพเภสัชกรรม